Duke-NUS 为希望进一步接受学术培训的学生提供联合的 MD-PhD 课程。该计划将医学教育与研究培训相结合，以培养在医学和科学之间进行交互的临床医生-科学家。所有被录取的学生都将获得博士学位的全额奖学金以及奖学金，以支付他们在医学博士课程的前两年和最后一年的医学博士培训的学费（资金数额将取决于助学金和其他奖学金已经授予协助MD学费）。
学生在完成第二年的医学博士课程后开始攻读博士学位。完成博士课程后，学生将完成医学博士课程的最后（第四年）。有兴趣的学生可以在初次申请时直接申请 MD-PhD 课程，也可以在进入 MD 课程后直接申请。每年，大约 15-20% 的 MD 队列可能会在 MD-PhD 轨道中获得一席之地。
所有 MD-PhD 项目的申请人都必须参加 MCAT。该项目不接受 GRE 成绩。假设成功满足要求，医学博士课程的学生将获得杜克大学和新加坡国立大学的联合医学博士 (MD) 学位。对于那些已经完成 MD-PhD 选项的人，博士学位将由新加坡国立大学授予。
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