有大量的机构对整个吉尔吉斯斯坦高等教育。这包括周围的37所公立大学和18所私立大学。突出的大学在吉尔吉斯斯坦包括中亚和吉尔吉斯国立大学。

博士课程通常是为已经获得硕士学位的学生所开设的。 此外，完成博士学位课程需要学生提交一篇包含原创学术研究的学位论文。 在一些国家，博士学位课程的学生还需要通过公开的博士论文答辩才能够被授予博士学位。